灰指甲是属于真菌感染，并不是细菌感染。
灰指甲也就是真菌感染到了甲床所引起的甲癣。常见的致病菌主要是皮肤癣菌，比如红色毛癣菌、酵母菌。主要侵犯甲板以及甲下组织，多数是由于足癣或者手癣、体癣等传染而来。多数是从指甲的前缘或者是侧缘开始逐渐蔓延，会导致指甲和甲床分离或者是甲板混浊失去光泽。
有的会出现灰色褐色的改变，指甲的表面也会增厚、变形、变脆，局部用药一般很难进入指甲的甲板。所以应该先用一些器械磨损指甲，然后再涂抹抗真菌的药膏。一般系统用药效果最佳，就是配合选择口服抗真菌的药物，在口服用药期间，需要定期检查肝功能。