癌胚抗原高本身并不会引起临床症状，但是如果癌胚抗原高是由于身体内存在恶性肿瘤所引起，患者就会出现一些临床症状。
癌胚抗原高可以由多种肿瘤所导致，例如肺癌、胃癌、乳腺癌、肝癌、肠癌等恶性肿瘤都可以出现癌胚抗原指标升高，因此临床上患者会有多种临床症状。
例如肺癌的呼吸困难、咳嗽、咳痰。胃癌的胃痛、胃胀、食欲下降。肝癌的肝区疼痛、饮食量下降。肠癌的便血、大便性状改变、腹痛等。而一些非癌症疾病所引起的癌胚抗原升高，多数情况下临床上没有症状。