克罗恩病的预防要分成两个方面：
第一、是未病先防，克罗恩病和溃疡性结肠炎一样，也是免疫系统紊乱的疾病，正常的人群一定要注意防寒保暖，注意清淡饮食，要注意积极地锻炼身体，提高胃肠道功能。
第二、如果发生了克罗恩病，那么它的预防就和溃疡性结肠炎不同，在一定程度克罗恩病程度比较严重。已经发生克罗恩病的患者，要注意长时间地保持在缓解期，保持在稳定期。尽量的减少住院率，减少手术几率。一旦增加一次手术，有关的研究表明可能复发率就会增加10%，而且以后的癌变率也会逐渐的增加。
长时间地保持在缓解期，有两个方面的努力，一个方面是医生要对患者定期的追踪，每过半年或者1年要定期的查炎症指标，比如白细胞、血沉、C-反应蛋白，还有一个目前国内使用比较广泛的钙卫蛋白，这是一个新的指标。患者一定要学会自我管理，比如在饮食方面，在情绪方面，还有在天气变化方面，一定都要非常注意。
只有这两个方面都做到了，让患者保持在很稳定的状态，才能达到既病防变，不至于进一步发展。