三叉神经痛的手术治疗方法主要有：三叉神经及半月神经节阻滞术、半月神经节经皮射频热凝治疗、微血管减压术。
三叉神经及半月节神经节阻滞术通过注射药物直接作用于三叉神经，造成三叉神经变性，以此达到止痛的目的，但疗效不能持久。半月神经节经皮射频热凝治疗是通过破坏三叉神经的痛觉纤维，而保留触觉纤维，达到止痛的目的，适用于不能做开颅手术的患者。
微血管减压术通过影像找出压迫三叉神经的责任血管，并进行切除，保留了三叉神经的正常功能，是目前三叉神经痛首选的手术治疗方法。