运动晕厥可能与心脏疾病有关，比如心律失常或者心脏瓣膜关闭不全，在运动时可能会使心脏负担加重，就会导致心脏疾病发作，使心脏射血受到影响，会使脑部的供血出现一过性减少或中断，就会导致晕厥。
运动晕厥还可能与颈椎病有关，如果患有比较严重的颈椎病，在进行运动时可能会导致椎动脉受到压迫，会导致脑严重缺血，就会出现一过性晕厥。
此外，如果女性存在体位性低血压，在运动后血管收缩功能较差，会导致血容量不足，也会出现运动晕厥。