瘫痪后肌肉萎缩主要是通过系统的康复治疗的方法，恢复神经肌肉的功能，防止肌肉萎缩。
当人瘫痪以后，神经对肌肉的支配减少、营养减少，所以就会导致肌肉萎缩。肌肉在不停地运动的情况下，才会保持肌肉的弹性以及维持肌肉的兴奋状态。当肌肉瘫痪以后，没有运动，肌肉就会导致废用性的萎缩，这很常见。
当出现肌肉萎缩的时候，要积极地康复治疗。比如可以做局部的按摩以及被动性的关节及肢体运动等，尽可能地减少肌肉萎缩的发生。出现瘫痪以后，导致肌肉萎缩必不可免，没有完全有效的办法能够抑制住肌肉萎缩，只能通过一定的康复治疗，减轻肌肉萎缩的程度。