肛门里面有脓胞是比较严重的，可能是发生了直肠黏膜下脓肿，是肛周脓肿的一种类型。
脓肿位于直肠黏膜与肌层之间的结缔组织内，会出现全身感染症状，如全身乏力、寒战、发热、食欲不振、肛门坠胀感。做肛门直肠指诊，在直肠壁上可触及一圆形隆起，有触痛和波动感，直肠黏膜下脓肿要及时做脓肿切开引流手术。
肛门里面有脓包还可能是肛周脓肿，脓肿由肛周脓肿腔内向肛门内、肛窦周围黏膜下扩散，在黏膜下形成脓肿。肛周脓肿手术时，一并切开引流脓液即可。