巩膜炎主要和表层巩膜炎、葡萄膜炎、视网膜下肿物、眼眶内炎症及肿瘤性疾病进行鉴别。表层巩膜炎，巩膜实质不受累，眼部滴用肾上腺素后充血的血管变白。比巩膜炎起病急，好发于年轻人，症状比较轻。葡萄膜炎，前房或玻璃体内有细胞。眼底萤光血管造影可显示脉络膜或视网膜层次的炎症。视网膜下肿物，眼底血管造影、眼部b超即可鉴别脉络膜黑色素瘤、脉络膜血管瘤、转移癌等等。眼眶内炎症及肿瘤性疾病，也可以导致眼球突出和眼球运动障碍，眼部ct、磁共振及超声检查，可以进行鉴别。