脑干出血去医院需要做头颅CT、头颅磁共振以及相关部位的其它检查，若考虑为脑干出血，去医院最直接的检查方式为头颅CT或头颅磁共振检查，以明确是否有脑干出血或者是出血量的大小及部位。
对于考虑是否为血管性疾病引起的脑干出血，则可以进一步行头颅CTA、MRA或者是脑血管造影的检查。
脑干出血的治疗可以分为保守治疗及手术治疗，脑干出血小于3毫升者治疗效果较好，但常伴有一定程度的后遗症。脑干出血量若大于5毫升，治疗效果极差。