患有鳃裂瘘管的患者是否可以接种疫苗，需要根据患者的病情程度及阶段来判断。
如果鳃裂瘘管并不严重，且目前并没有感染的情况出现，患者本身也并不存在其他严重影响身体健康的器官发育畸形的表现，同时也没有严重的自身免疫系统疾病，通常都是可以正常接种疫苗的。
但如果患者正处于鳃裂瘘管感染的急性发病期，身体有严重的高热、耳道流脓、颈部肿痛等异常表现，或者是伴随有其他身体器官的严重畸形，则建议应该在炎症感染消退后，再进行疫苗的接种。