对侧中枢性面瘫的原因，主要是因为同侧神经支配对侧面部肌肉，一旦损伤，导致对侧面下部肌肉即脸颊肌、口大肌和口轮匝肌麻痹。
因此，当病人休息时，这边的鼻唇沟变浅、嘴角下垂、嘴角向健康侧倾斜。而脸部上部的肌肉并没有瘫痪，因为他们闭上眼睛、扬起眉毛、正常地皱眉、额线深度与对侧相同，眉高、睑裂大小与对侧相同。
中枢性面瘫常伴有偏瘫症状，颈内动脉闭塞及面神经核上行通路的任何部分损伤，均可引起中枢性面瘫。