肛门镜一般是没有无痛的检查。如果进行无痛的肛门镜检查，需要在麻醉的状态下进行，或者是在肛管直肠内放入止疼的药膏、药栓之后，再进行肛门镜的检查，可以缓解肛门镜检查时的疼痛和坠胀感。
肛门镜的检查一般较为简单，在门诊就可以完成，也不需要进行特殊的肠道准备，只要是在检查之前排空肛管直肠内的粪便，对肛门局部做简单的清洗，就可以完成肛门镜的检查。
如果患者肛门口有肛裂或者是痔疮等，可以引起肛门疼痛的疾病，一般是不进行肛门镜的检查。如果是必须要进行的肛门镜检查，可以在麻醉的状态下进行。