较小的舌下腺囊肿，可以不予处理。较大的囊肿，为防止复发，常将腺体和囊肿一并切除。对于不能耐受手术者，可以选择将囊液抽出注入碘制剂，待内部纤维化之后，恢复正常大小。
舌下腺囊肿早期可以没有自觉症状，随着肿物的逐渐增大，舌体被抬高，进而影响吞咽、语言、咀嚼。位于口外型的囊肿，可在颈部见到较大的隆起，甚至造成呼吸困难，囊肿继发感染时局部表现为红肿、疼痛。
舌下腺囊肿一般呈淡蓝色，囊壁一般较薄，当囊壁被刺破之后可以见到有淡黄色、粘稠、蛋清样的液体溢出。