急性骨髓炎治疗后全身症状消失，遗留有局部症状，一旦形成死骨就会变成慢性骨髓炎。
慢性骨髓炎通常的治疗方法是手术治疗。手术治疗主要方法是应用抗生素抑制感染，再通过外科手术彻底清创。然后将缺损的骨质和软组织重建，达到完全愈合慢性骨髓炎。
清创就是清除所有的死骨和骨坏死的部分，直到出现了有活力的骨质。然后可以应用含有抗生素的链珠或者含有抗生素的骨水泥等，填充缺损的骨。，然后应用负压吸引促进软组织愈合，或者将正常软组织转移包裹缺损的创面，达到骨髓炎的愈合。