孕酮低通常与黄体功能不全有关系的，孕早期可以通过孕酮的水平来判断胚胎的活性，了解有无流产的风险，也可以通过孕酮的水平预测是否有宫外孕的风险。
若已经确定是宫内妊娠，孕酮低可以口服黄体酮或者是注射黄体酮，避免因为孕酮低导致流产。还可以通过饮食的方法来调节自身的孕酮值，从食物中摄取含有较为丰富的大豆异黄酮与天然维E的成分，而对于食物中的这些成分，可以帮助女性自身产生比较多的孕酮，有辅助作用，但是还是以药物治疗为主。