长期服用重症肌无力的药，会存在一定的副作用。
目前对于重症肌无力的治疗方案，多采用激素类药物的干预，而此类药物常存在致使患者面部多发痤疮、水牛背等，典型激素服用后征象。同时，由于长期的外源性激素干预，容易导致体内内分泌水平紊乱，从而容易产生感染或影响免疫功能。但是，此类药物总体仍利大于弊，重症肌无力患者若不进行药物干预，随着疾病的进展，可致呼吸肌无力，最终产生窒息这一威胁生命的严重后果。
因此，即使治疗重症肌无力的药物，存在一定的副作用，亦不可以擅自停药或减量使用。