恐水症到底会持续多久，因人而异。一部分恐水症的患者经过积极有效的治疗后，病情都可以缓解，因此对水源的恐惧，会随着病情的康复而好转或消失。该病的疗程如果10天见效，患者就有可能恐水10天左右。
但是由于该病的治疗难度非常高，因此很多患者会严重到最终死亡。这种情况下，恐水会伴随着整个疾病的发展，短则几天长则几个月，并没有一个明确的期限。
临床上大部分恐水症的患者，对水源的恐惧时间要短于整个病程，这一点尤为重要。