下呼吸道感染是否能自愈，与感染的致病原以及感染的严重程度等有一定的关系。例如由病毒、支原体、军团菌等引起的下呼吸道感染，此些致病原有一定的自限性，故对于轻症的患者通过早期的干涉处理，疾病有可能自愈。
但对于感染程度重以及基础抵抗力差，此时疾病是不能自愈，患者多需要积极的抗感染对症治疗，防治相应的并发症，促使其尽快的痊愈。此外，对于轻度肺结核患者，如果其自身机体抵抗力较强，也有可能自愈。但对于细菌性下呼吸道感染是没有自限性的，患者也不能自愈，需要抗炎治疗。
另外，对于真菌导致的下呼吸道感染也不能自愈，患者也需要早期抗真菌的治疗。故当发生下呼吸道感染时，一定要分析其病情，再针对性的处理。