慢性自身免疫性甲状腺炎，主要包括桥本甲状腺炎、无痛性甲状腺炎、产后甲状腺炎、无痛性甲状腺炎和产后甲状腺炎，典型的患者会经历甲亢期、甲减期，最后恢复到甲状腺功能正常期，疾病具有自限性不需要治疗。
桥本甲状腺炎的患者，如果没有侵犯到功能，患者可以没有任何的症状和体征，也可以不治疗。如果侵犯到功能可以出现甲亢，需要给予抗甲状腺药物治疗，选择丙硫氧嘧啶或者是甲巯咪唑都可以。如果出现了甲减，则需要给予永久性的甲状腺激素替代治疗，可以选择的药物有甲状腺素片、LT3或者LT4，一般会优先选择LT4。