输尿管软镜取石，可能会留下以下后遗症：
1.结石残留。输尿管软镜取石主要是将结石粉碎成较小的结石，有一部分结石可以取出，但有少部分细小的结石可能还会停留在肾脏内。需要通过多喝水、勤排尿，将结石排出体外。如果结石残留较大，还需要再次进行碎石术治疗。
2.术后有可能引起炎症或狭窄。因为输尿管软镜需要通过膀胱进入到输尿管，可以刺激输尿管局部的黏膜，容易引起炎症。如果出现缺损，也有可能会导致管腔狭窄，术后有可能会出现继发性的肾积水。
3.输尿管软镜取石通常需要留置输尿管支架管，时间过长有可能会引起排血尿或者出现腰部疼痛。