脚踝腱鞘囊肿的治疗，要根据囊肿的部位、大小以及症状来选择方法。
如果囊肿的体积比较小，周边也没有非常重要的血管以及神经，并且患者没有感觉到不适，不影响正常的行走和功能，可以先不用治疗，但要密切关注囊肿的变化以及自身的症状。
如果囊肿比较大，有明显的疼痛，并且对与其相邻的血管和神经产生压迫，影响到正常的功能，囊肿的生长速度也非常快，必须及时进行治疗。可先通过保守治疗，向囊肿部位注射药物。如果经药物治疗效果不明显或者反复地发作，应该及时进行手术将囊肿切除。