理论上三毫米的胆结石比较小，一般不会引起相应的临床症状或者造成胆道系统或肝功能的损伤，通常情况下不需要手术治疗，可以通过大量的饮水配合运动，也可以服用鸡内金或熊去氧胆酸的药物进行治疗。
因此绝大多数情况下，三毫米的胆结石不会造成严重的疾病，即使胆结石较小，也不排除结石掉落至胆总管的末端，划伤胆道壁造成胆管水肿，引起梗阻，从而诱发梗阻性的黄疸或肝功损害等一系列症状。
如果结石在胆道系统内长期没有排出，结石可能会逐渐增大，最终诱发相关的疾病。