肛门边长水疱瘙痒，可能是单纯性疱疹、过敏因素、尖锐湿疣等原因引起。
单纯性疱疹是由于感染疱疹病毒引发，主要表现为肛门局部会出现水疱瘙痒，经常抓挠会造成水疱破溃渗出液体，引起肛门潮湿，确诊后需要给予抗病毒的药物治疗。
过敏因素也可造成肛门长水疱，比如接触过敏的物质或者服用某些过敏的药物，吃过敏的食物也会造成肛周出现较多的小水疱瘙痒，需要给予抗过敏的药物治疗。
此外，尖锐湿疣也会引起肛门长水疱样的物体，伴有瘙痒、疼痛，需要给予电灼、激光、手术切除治疗。