肛门湿疹通常会瘙痒的很剧烈，但是局部的皮肤通常又会比较薄，所以在抓了以后很容易出现破损的情况，伴随着疼痛的出现，所以外用药物通常需要抗感染和抗过敏药物同时进行使用。
常用的抗感染的外用药，包括红霉素软膏以及克林霉素软膏等。而用于肛门部位的抗过敏的药膏通常有蜈黛软膏或者是丹皮酚软膏或者是康酸莫米松凝胶等，可以将上述两类药膏按照1:1的浓度进行混合，然后一天2~3次，薄薄的涂抹在肛门湿疹的部位。平常注意保持局部干燥。