亚急性联合变性有可能会有后遗症。亚急性联合变性的后遗症主要包括痉挛性截瘫、共济失调、精神异常以及痴呆。
一般亚急性联合变性的治疗效果较好，只要患者能够在早期发现、早期治疗，大部分患者都能够痊愈。但是，如果患者没有得到早期及时的治疗，延误了治疗时机，则有可能会导致以上的后遗症出现，从而影响患者的生活质量。
亚急性联合变性的治疗，主要是补充维生素B12以及营养神经。如果患者一旦形成了后遗症，则需要积极地进行康复训练，以挽救患者的神经功能。