对于衣原体尿路感染会出现如普通细菌一样的泌尿系感染刺激症状。如尿频、尿急、尿痛，而在男性和女性当中又略有区别，因为男性泌尿道和生殖道是属于同一个排出器官，也就是阴茎。男性的尿路感染会有典型的尿路刺激症状，以及尿道刺痛和烧灼感。在有的患者当中会出现尿道外口会有一层荚膜，而对于女性患者除了有泌尿系感染症状存在，还会存在宫颈和阴道的刺激症状，因为如果没有带安全套进行性行为，那么男性的衣原体感染会导致女性生殖道感染。
因此，女性同样存在泌尿系刺激症状以及阴道炎、外阴瘙痒等症状。