对于衣原体尿路感染主要是由于衣原体导致泌尿系统产生感染。一般好发于青年男性和女性，男女比例一般都差不多，而男性会导致衣原体生殖道感染以及衣原体的尿路感染，在女性，由于不洁的性生活会使男性的衣原体尿路感染导致女性妇科疾病，如衣原体阴道炎。对于此类尿路感染以及生殖道感染需要去泌尿外科进行及时就诊。
检查衣原体培养以及细胞学检查，同时可以进行pcr也就是聚合酶链式反应，如果证实衣原体感染存在可以使用阿奇霉素来进行对症治疗，治疗之后需要去泌尿外科进行复查，看衣原体是否转为阴性。