跑步后脑勺疼，可能是剧烈运动、大脑缺血、缺氧、寒冷的刺激引起的疼痛。
跑步的时候后脑勺疼，主要考虑与运动的幅度过大有关。比如剧烈的运动导致全身的血液流动加速，血管扩张，脑血管收缩、痉挛，会引起头疼。建议放慢跑步的速度，尽量以慢跑为主，可减少头疼的情况出现。
跑步时人体会处于高氧能状态，会对神经造成一定的刺激，部分患者跑步时也会出现后脑勺疼痛的症状。如果进行剧烈的运动，比如快跑，导致呼吸频率增快，大脑供血、供氧不足，会对脑神经造成刺激，导致后脑勺疼痛。
跑步后后脑勺疼痛，也可考虑与局部受寒有关。剧烈的运动导致身体发热、出汗，跑步后不注意防寒保暖，受到冷空气的刺激，导致头部受凉，也会引起头疼。