手术治疗乳腺肿瘤的风险大小，要根据乳腺肿瘤的性质来定，如果是良性肿瘤的切除手术，手术切除的范围通常是乳腺区段切除，创伤不大手术风险也很小。如果是乳腺癌手术主要有保乳手术和全乳房的切除手术。
保乳手术的手术风险主要在于手术切缘距离肿瘤过近，术后会出现复发转移等风险，因此在乳腺癌保乳手术以后通常要进行放射治疗。
乳腺癌在做全乳房切除手术，尤其是加行腋窝淋巴结清扫手术时，手术风险相对较大，主要有损伤血管导致出血以及胸长神经以及胸背神经的风险。