肿瘤标志物检测的项目有许多种，例如甲胎蛋白、癌胚抗原、各种糖类抗原等。一般临床上根据检测的目的不同，或者肿瘤检测的类型不同，从而选择性地检测几项指标，例如肿瘤标志物的检测为了健康查体。女性可以考虑检测妇科恶性肿瘤指标，或者乳腺恶性肿瘤指标，例如糖类抗原125、糖类抗原153等。
如果男性可以考虑检测前列腺癌指标，例如PSA等。如果确诊肿瘤，为了辅助诊断或者监测病情变化，需要检测几个项目。对于胃癌，可以检测癌胚抗原、糖类抗原724、糖类抗原199。而对于乳腺癌，可以检测癌胚抗原、糖类抗原153等。如果是腺癌，主要检测糖类抗原125。神经内分泌癌可以检测神经元特异性烯醇化酶等指标。