沙眼的诊断依据主要有
一，上穹窿及上睑结膜血管模糊、充血、乳头增生或滤泡形成，或者两者都有。
二，角膜边缘血管翳。
三，上穹窿、上睑结膜出现典型的结膜疤痕，线状或网状的白色瘢痕。
四，角膜缘滤泡，或滤泡消退以及坏死后遗留的痕迹。
具备上述4个里面的两个或两个以上的特点就可进行临床诊断为沙眼。病原学诊断，则需要结膜刮片找到沙眼包涵体，沙眼衣原体的PCR检测及培养。