新生儿低镁血症的鉴别主要与低钙血症相鉴别，临床2/3的低镁血症伴发低钙血症，因此，对钙剂治疗无效的患儿应考虑有低镁血症的可能，心电图和实验室检查可助鉴别。
正常新生儿血清镁为0.8～1.15mmol/L，离子镁为0.40～0.56mmol/L，血清镁<0.66mmol/L为低镁血症。当血镁低下时，神经系统的兴奋性增加，临床上可以出现类似低钙惊厥，主要见于3个月以下单纯牛奶喂养的婴儿，尤其是新生儿。常见的病因有：先天性镁储备不足、镁摄入减少、镁丢失增加。