气管食管瘘支架的作用原理是通过在气管与食管之间窦道的气管或食管一侧放置带膜支架，起到阻断气管与食管之间交通的作用。
窦道被阻断后食管内容物无法通过窦道进入气管内，可以防止误吸，避免肺部感染，减少全身营养的消耗，使窦道内的肉芽生长速度加快，同时带膜支架可以为肉芽生长提供附着点，使窦道内的肉芽更容易生长，最终达到消灭窦道的目的，使患者能够痊愈。
另外通畅引流、加强营养支持可以进一步的促进气管与食管之间窦道的愈合，气管食管瘘是一种严重的并发症，严重可危及患者生命，早发现、早治疗可以改善患者的预后。