如果是首次出现短暂性脑缺血发作，通常不会遗留后遗症。但如果是反复出现的短暂性脑缺血发作，且患者没能及时进行对症有效的治疗，致使神经功能受损，则可能会遗留后遗症。部分患者的后遗症表现为记忆和情感障碍。如果是高龄患者，通常表现为血管性痴呆的后遗症。
除了可能会造成后遗症以外，短暂性脑缺血发作时，如果患者的供血动脉闭塞，没能及时进行干预治疗，还可能会导致脑细胞坏死。对患者局部的脑功能造成损伤，使患者出现肢体乏力或中风等。
因此，针对短暂性脑缺血发作应及时明确诱因，对症治疗，避免引发后遗症。