通常单凭核磁共振检查并不足以确诊癌症。因为确诊癌症的最重要手段，到目前为止仍然是病理学的检查手段，也是诊断癌症的金标准。
但是通过核磁共振检查，能够帮助发现一些癌症的病变。尤其是在增强核磁共振影像中，一些怀疑是恶性的病变，可能显示一些恶性肿瘤的形态。比如边界不清晰、血液供应比较丰富等情况，这个时候有助于对恶性肿瘤的一些早期判断。
如果怀疑一个核磁共振的影像是恶性病变，可以进一步在CT或者B超的引导之下，做病变的穿刺活检、病理检查，进一步明确病变的良性或者恶性，才能有效指导后续治疗。