由细菌感染导致的红眼病，特征性表现是急性乳头状结膜炎伴有卡他性或黏液脓性渗出物。根据临床表现，分泌物涂片或结膜刮片检查，可以作出诊断。结膜刮片和分泌物涂片染色可在显微镜下发现大量多形核白细胞和细菌。
由病毒感染引起的红眼病，特征性的表现是急性滤泡性结膜炎和炎症晚期出现角膜上皮下浸润。结膜刮片可以看见大量单核细胞，有假膜形成时中性粒细胞数量增加。病毒培养，PCR检测，血清学检查可以协助诊断病毒性结膜炎。