新型冠状病毒在传播过程中会发生变异，目前对于2019新型冠状病毒可以通过鼻咽拭子进行核酸检测，通过核酸检测阳性结果，来判断是否感染2019新型冠状病毒。
对于变异的新型冠状病毒，目前采用高通量测序技术可以检测出来。
高通量测序是指针对样本中所有的核酸或者特定靶向目标的核酸，进行宏基因组测序、探针捕获测序或者多重PCR扩增子测序的方法，通过生物信息学分析，检测样本中的可能感染的所有病原微生物或者是靶标的序列，包括发生变异的新冠病毒也可以被检测出来。