肠炎导致的疼痛主要是肠道痉挛痛，可以用解痉药物治疗，比如匹维溴铵、阿托品、654-2等，如果口服这些药物没效果，可以肌注间苯三酚、盐酸屈他维林等药物。疼痛严重时暂时不要吃东西，或吃清淡容易消化的食物，不要吃刺激肠道的食物。
伴随腹泻、呕吐时，及时补液，防止出现脱水和电解质紊乱。细菌感染导致的肠炎需要及时抗感染治疗，比如用左氧氟沙星、莫西沙星口服或静点。伴随黏液脓血便，高度怀疑溃疡性结肠炎、肠道肿瘤时，及时做肠镜检查明确，取病理活检。
溃疡性结肠炎及时抗炎治疗，肠道肿瘤及时手术治疗，两者治疗后均需少渣饮食，定期复查肠镜。