肩胛骨下方疼痛，如果是软组织劳损或骨骼关节诱发的无菌性炎症造成，可以应用非甾体类药物治疗，如吲哚美辛、塞来昔布、布洛芬等。
也可以搭配糖皮质激素、氨基葡萄糖等药物，营养局部软组织及骨骼关节，改善疼痛症状。具体到用药及用量还应遵照医嘱，避免擅自服用。
如果肩胛骨出现占位性病变或肿瘤引起的疼痛，不能单纯依靠药物治疗，需要完善检查诊断后及时进行手术治疗。如果肩胛骨伴有骨质疏松或骨骼钙化增生等问题，还可以应用一些钙剂或玻璃酸钠等药物。