近视激光副作用，主要包括术后近视欠矫或过矫变成远视,、屈光回退，可能出现暂时性的干眼症。光学像差相关的主诉，例如眩光、光晕、单眼复视等，在夜间时更明显，也可能出现角膜上皮下雾状浑浊，角膜上皮植入。
弥漫性层间角膜炎，又称为撒哈拉综合症，是角膜瓣层间的一种非感染性弥漫性炎症，可使用局部或全身糖皮质激素治疗。角膜瓣相关的并发症以及进行性角膜扩张、感染性角膜炎，多数与手术前存在睑缘炎，长期应用激素等因素有关。