慢性肉芽肿病一般是患者在幼年就开始发病，患儿容易有细菌或者是真菌引起的反复，或者是严重的感染，可以给患儿带来伤口愈合的异常或者经久不愈合。
患儿容易出现腹泻，并且容易有感染性皮炎、结核感染等疾病，包括有一些患儿，甚至在接种的卡介苗以后也容易感染。患儿还容易患有各种器官的炎症或者是肉芽肿的病变，患儿生长迟缓，常常容易并发慢性肺疾病和自身免疫性疾病，但是患者却不容易得癌症。
慢性肉芽肿病是一种先天性免疫缺陷性的疾病，可以导致机体容易感染炎症和肉芽肿的形成。它的治疗主要是在于预防和治疗感染，一旦患者感染了病原体，一定要选用比较强的抗病原体的药物进行治疗，量要足，周期要比一般的使用时间要稍微长一些。