小儿脑干胶质瘤可通过颅脑CT、磁共振以及活检术等检查确诊。患儿通常会出现走路不稳、言语不清等症状，在进行CT检测时，会发现脑干部位存在占位性的病变，并且脑瘤的显像效果不佳。
磁共振检查能够发现脑干形态庞大，并且边界不清楚，可伴有颅内出血以及囊变，还需采取局部的肿瘤组织进行活检。
小儿脑干胶质瘤还应当与脑干脑炎、小脑肿瘤等疾病进行鉴别，通过综合判断，可确诊为小儿脑干胶质瘤。在确诊以后，可通过手术疗法、放疗、化疗等进行综合治疗。