治疗慢性咽炎的最佳的方法是要确定病因，针对病因进行治疗。
慢性咽炎属于非炎症感染性疾病，而是由于急性咽炎没有得到彻底的治疗，以及生活环境中多发的疾病诱因造成，因此去除病因非常重要。对于咽喉部位有残留的炎症感染的患者，应当应用足量的抗生素类药物来治疗，经常抽烟喝酒、辛辣或过烫饮食的患者，则应当尽快改善不良的饮食习惯，戒烟、戒酒。
工作或生活环境中粉尘或不良的化学刺激品较多的人群应该尽快远离刺激性环境，保持空气环境的干燥、卫生，避开过敏原，都有利于慢性咽炎的治疗。