肛门疼痛是肛裂的一个主要症状，但是其它的疾病也会引起肛门疼痛。
肛裂的形成主要是由于排便时，坚硬干燥的大便不容易排出，强行用力排便，导致肛管局部的皮肤出现裂口。主要的症状就是肛门疼痛，疼痛犹如刀割一样，可持续一个小时左右或出现阵发性的灼痛，并伴有便血。
引起肛门疼痛也可能是因为痔疮、肛周脓肿，这些疾病也会引起肛门疼痛。痔疮在脱出肛门出现发炎、充血、水肿或者嵌顿形成血栓时，肛门的疼痛感也较为剧烈。肛周脓肿主要是化脓性的炎性疾病，主要的症状就是肛门肿胀、疼痛。