做B超检查是能看到卵巢囊肿的。B超检查是一项无创检查项目，能很好地反映出盆腔内是否存在结构异常的情况，如子宫肌瘤、卵巢囊肿、盆腔包块等。但检测功能性的异常情况条件有限，如卵巢功能衰退等疾病是检测不出来的，需要结合症状、抽血化验等综合评判，所以B超不能代替一切检查项目。
另外，卵巢大小在整个周期过程中会出现大小不一的情况，所以不能仅凭借一次检查来判断卵巢囊肿的情况。这主要是与卵巢在周期中经历了卵泡期、黄体期有关。
所以卵巢囊肿可存在生理性囊肿和病理性囊肿两种。其中前者与月经周期有关，即每次在月经前出现而月经后消失，而后者是持续存在，与月经周期无关。