爬山膝盖疼的原因是轻微的扭伤或者因为劳累，膝盖本身的疾病也会出现这种疼痛。
一般爬山有不平的道路或者膝盖长期处于半屈曲会出现局部的不稳，加上比较劳累时滑液分泌不足，或者其他的扭伤容易造成局部膝盖的疼痛。在不平的道路上，长期地上下容易造成膝盖损伤。同时，如果爬山时间比较久，虽然道路平整也超过膝盖和肌肉承受的能力，肌肉会有渗出、乳酸堆积造成关节腔压力增大，滑膜分泌增多以后，刺激神经也会出现轻微的积液和疼痛。
膝盖如果本身有疾病，像退行性关节炎以及既往有韧带、半月板损伤，包括其他的疾病像风湿、痛风等，已经造成膝盖损伤，在爬山时劳累等会加重损伤和刺激出现疼痛。