萎缩性咽炎和肥厚性咽炎都是属于咽炎，两者都是发生在咽部黏膜、黏膜下及其淋巴组织的慢性炎症。萎缩性咽炎的患者，咽部的黏膜变薄、萎缩。肥厚性咽炎的患者局部相关的组织出现了增生，二者的症状相似。
在治疗上，萎缩性咽炎主要是治疗根本的原因以及对症治疗。肥厚性咽炎主要是用克拉霉素、呋喃西林溶液、庆大霉素等药物治疗，还可以用烧灼法、物理疗法等方法治疗。
无论是哪种咽炎，都要及时治疗，以免导致不适加重，引起其他并发症。