肛窦炎以及肛乳头炎，在中医上认为本病的形成大多是因为饮食不节，过食肥甘厚味和辛辣等刺激性食品，所致湿热下注，浊气内生，或者湿热与气血相互搏结，经络阻塞而发病。
西医是由与肛门局部的解剖关系，刚窦开口向上，平时肛腺分泌粘液润滑肛管，以辅助排便，对肛门也有保护作用。
如患肠炎、腹泻、干硬粪便损伤肛瓣，以致肛窦内存积粪便和分泌物堵塞、细菌感染，就有可能会导致肛窦炎。而肛窦炎后，就有可能会导致相应肛乳头炎肿大，出现肛乳头炎。