患有婴儿型黑朦性痴呆的后遗症是有很多的，主要的会有痴呆、瘫痪，有的还会有双目失明。因为婴儿会出现有严重的抽搐，每次发作的时间会比较长，缺氧会对婴儿的大脑造成很大的损伤，导致婴儿在运动和智力方面的发育出现很明显的落后，会出现智力障碍。
运动方面有的也无法自由活动，严重的就会有肢体瘫痪。另外小儿的视力也会减退，由于视网膜萎缩和视神经萎缩会导致小儿的双眼出现失明。
这是一种遗传性的疾病，目前还没有彻底根治的办法，对小儿的危害还是很大的，最好是在小儿出生以前就要做好优生优育的工作。