肛门附近长水疱，首先考虑有病毒性感染的存在。比如有带状疱疹的情况，可能会出现肛门附近长水疱的情况，并且会出现局部的疼痛，并且具有一定的传染性。
另外，考虑是痔疮出现了水肿的情况。由于痔区静脉血液和淋巴回流变差，使血液和淋巴淤积在皮下，进而会表现为长水疱的情况。
再者，排除是不是由于外来的损伤，所引起的张力性的水疱，还需要排除是不是有肛门周围脓肿的情况。如果有肛门周围的脓肿，局部的压力会增加，也可以表现为皮肤上水疱的情况。
建议患者先到正规的医疗机构进行就诊。主要的治疗方法就是通过药物治疗，或者是通过手术治疗。